在代歐奇希斯（下代歐）變成防型態(tài)與裂空坐持激戰(zhàn)的同時，拉斯市廣播系統(tǒng)昭大家緊急避難。民們聽到廣播后驚慌疏散。代歐時又變成攻擊型，并對裂空坐釋攻擊。廣播持續(xù)吁民眾這并非演，而小超則在逃中的人群當(dāng)中，惑不解為何代歐活著。當(dāng)小超在難時遇見一只難的正電拍拍。小一看到神奇寶貝時嚇壞了，但聽它的求救聲便鎮(zhèn)下來。原來它的伴負(fù)電拍拍被陷垃圾桶里無法掙，小超決定幫忙當(dāng)他打開垃圾桶時，忽然負(fù)電拍迫不及待地沖出！小超又嚇壞了不由自主地想要離現(xiàn)場，這時忽小卡比獸也從垃桶冒出來！可憐小超就這么昏過了。之后小智趕發(fā)現(xiàn)不省人事的超，便用盡方法把小超叫醒。小蘇醒后卻不高興嫌小智多管閑事背景的小卡比獸撿著垃圾吃）。時小遙、小剛、太、阿隆、一位性和兩位雙胞胎生也趕到，而小正催促小超趕快難。但小超還來及動作，忽然一死光射到他們附的地面，把大家得魂飛魄散！大驚魂甫定時，小告知有個地方可躲難，一行人便了過去。 小超帶大家來到他之前的玻璃溫室植物。當(dāng)小超對植物的入口讀卡機(jī)刷時，發(fā)現(xiàn)讀卡機(jī)障，門打不開了正太自告奮勇地雙手奮力把門扳。當(dāng)大家為正太采時，阿隆盯著智看，輕蔑地說智怎么還待在拉斯市里，以為他敗后早該羞愧地老家了。小智生地說要再跟他比場，小遙只得勸說現(xiàn)在不是時機(jī)但這時一旁的兩雙胞胎女生加油醋地說她們的哥絕不會輸給小智小智質(zhì)問她們是，而那位女性解那兩位小女生是太的妹妹們，オドリ（暫：大鳥和キャサリン（：凱薩琳）。女則自我介紹是ヒミ（暫：小瞳）接下來我們都知小剛會做出什么應(yīng)啦，而小勝也刻拉走小剛的耳。 之后阿隆問大家該如常羲在植物里打發(fā)時間，而瞳則拿出筆記型腦開始查詢那只DNA神奇寶貝的資料。但出乎她意之外并沒有任何歐的資料，正太催促她繼續(xù)嘗試背景的小卡比獸在睡覺）。此時智詢問一臉哀傷小超怎么了，而其他人的關(guān)切下小超開始訴說他年前的經(jīng)歷。小仰望著還在激戰(zhàn)兩只神奇寶貝，大家（除了小卡獸）的全神貫注，說代歐是從宇來的。四年前一隕石擊中地表，從隕石中，迸出只被倫多博士命為“代歐奇希斯的神奇寶貝。由它侵犯了裂空坐大氣層領(lǐng)域，于大激戰(zhàn)開始。裂坐的破壞死光之準(zhǔn)準(zhǔn)地轟碎代歐希斯，成為零星片。阿隆對小超故事懷疑并嗤之鼻，而正太也叫超別把他們當(dāng)小騙，并反問為何歐現(xiàn)在還活著？超只能回答他不道。 此時在溫室植物園上空，代開始復(fù)制自己的影子代歐”分身分身群一看到四躲藏的驚慌市民居然就開始沖下，擄走市民到不名的地方去了！ 在植物園中小智們?nèi)越逯⊥?腦收聽廣播。記播報(bào)現(xiàn)在拉魯斯被?\罩在代歐所形成的透明罩里法對外通行，并影子代歐們?nèi)喝?停地?fù)镒呷藗儭?瞳關(guān)掉電腦，正則擔(dān)心被困在這。在窗外的影子歐群不時地逼近把大鳥和凱薩琳哭了。忽然一只身沖破玻璃屋頂來，小超看到趕叫大家趕快跑，影子代歐卻已經(jīng)下來了！正太叫水箭龜用高壓幫，卻對影子代歐效。就在正太納 悶為何無效的時，從背后另一只子代歐偷襲正太水箭龜，從屋頂洞把他們擄走了阿隆生氣地叫出焰雞使出火焰飛，小智叫皮卡丘十萬伏特，小瞳出巨金怪用彗星，雙胞胎叫出溜糖球和雨翅蛾用沫光線。這些神寶貝在對付影子歐群時，小智叫家趕快逃走，阿則問小超是否知緊急出口在哪。然小剛發(fā)現(xiàn)他的貝球無法打開了其他人也驚覺他的也不行。 影子代歐又殺出重圍近小超，害他只繼續(xù)逃躲。阿隆火焰雞攻擊影子歐，并叫大家別他而先行逃離。隆請小遙照顧好的兩個妹妹，但遙不想丟下阿隆管。此時小剛正急地想叫醒小卡獸（居然到這節(jié)眼還在睡），而焰雞持續(xù)使出上拳拖延時間，讓遙她們有時間跑出口。小遙叫正戰(zhàn)斗的小智他們快跑過來，但小他們還是吩咐小她們先行離開。然，小卡比獸打大大的呵欠，同嘴里冒出白光照整個溫室，居然所有影子代歐給分解了！小智他便趁機(jī)跑向出口開。 此時在倫多博士的研究實(shí)驗(yàn)里，倫多博士不人事地躺平。助春野手持電擊棒嘴里假惺惺地感倫多博士的努力給他不少的方便忘我地盯著水晶體，幻想自己能何地從中獲得暴和權(quán)勢并掀起神寶貝界的大革命這時忽然有人敲把春野嚇了一跳原來外面是小超一行人，小超則一行人解釋實(shí)驗(yàn)是建造在植物園底下。春野這時門讓大家進(jìn)去，實(shí)驗(yàn)室里都不見多博士的人影。超問春野父親的落，春野騙說倫博士已經(jīng)出門找了。小超擔(dān)心外那么危險(xiǎn)爸爸會會有事，春野則小超不要窮擔(dān)心小智打算出去尋博士，但阿隆則小智不要貿(mào)然行造成大家的擔(dān)心一群人便待在一等倫多博士回來 已經(jīng)晚上了，卻仍不見倫多博士蹤影。大鳥和凱琳一直喊累喊餓阿隆只好哄她們靜再等一下。此小卡比獸手拿著明治走向大鳥和薩琳，那對雙胞以為這只好心的奇寶貝帶給她們物，卻看到小卡獸當(dāng)面把三明治掉了！兩個女生時大哭，小智則定要出外找食物阿隆仍是提醒小外面的危險(xiǎn)，但次小智毅然地跑去，阿隆和其他只好尾隨。 在外頭可看到影子代四處飄移，如同巡邏一般。小智們放低姿態(tài)以免發(fā)現(xiàn)，并一起計(jì)找尋食物大作戰(zhàn)當(dāng)影子代歐暫時開后大伙便分頭進(jìn)，而小智、皮丘和小剛找到了臺熱狗販賣機(jī)，電源切斷了。小叫皮卡丘使出十伏特，那臺電動賣機(jī)便一邊啟動邊播放音樂，熱不停地掉出來，剛他們就盡可能抓了一大把。忽，小剛把小智壓地上，并叫他不出聲，原來頭頂飄著一群影子代。小智他們躲在賣機(jī)后面，但機(jī)的音樂卻還在播！影子代歐聽到樂后往販賣機(jī)逼，小智他們則嚇以為死定了。忽小超和正、負(fù)電拍從另一頭走出，完全不知道影代歐的存在。分們立刻沖向小超但正、負(fù)電拍拍合用了電擊絕招護(hù)小超。這時，只影子代歐倏地住負(fù)電拍拍和小！小智便奮不顧地抓住那只分身猛咬它的一只手，小超便掙脫成了。小智問小超否安然無恙，皮丘則持續(xù)攻擊其分身。但為數(shù)實(shí)太多了，小智叫家趕快逃離，但超仍擔(dān)心負(fù)電拍的安全。小剛呼他們自身的安全重要，于是他們逃離現(xiàn)場了。他來到一間開著窗的建筑物，于是爬進(jìn)窗戶躲藏。子代歐群飛掠過，幸好沒有發(fā)現(xiàn)智他們的蹤跡。稍微喘氣后，小發(fā)現(xiàn)正電拍拍為的同伴難過，便著撫摸安慰正電拍，卻因?yàn)橛啄?傷的身體排斥反讓他無法這么做只好對正電拍拍歉。此時皮卡丘這棟建筑里找到瓶水，讓大家心好了起來。 之后大家費(fèi)了一番力回到實(shí)驗(yàn)室，并面吃著熱狗一面贊多好吃。此時隆指著小瞳的電廣播，告訴小智些被影子代歐擄的人們（包括火隊(duì)…和可達(dá)鴨）被帶到不知名的方。小剛對那個定地方感到奇怪這時忽然聽到倫博士的聲音！原他從柜子里昏沈爬出來，顯然不道自己被電昏的情。博士說代歐在找它的朋友，問大家春野在哪。大家說春野出了，博士環(huán)顧四發(fā)現(xiàn)水晶球體不了。小超問父親是什么，倫多博則回答，那球體代歐奇希斯的另部份身體。之后士透露原來那球就是讓代歐再生復(fù)制的關(guān)鍵！小告知春野帶著球離開了，阿隆則測原來代歐就是了找回這球體才回攻擊大家的。 忽然，之前在植園里的神秘光芒出現(xiàn)在小超面前他“談話”。小向大家介紹這是在植物園認(rèn)識的友，之后那光芒成另一只代歐奇斯的身影。小超訴父親或許水晶體還有生機(jī)，便出去尋找，后面著其他人。 此時在拉魯斯市的偏處，春野帶著一箱子瘋狂地跑。然從兩只神寶的斗中射來一束死，在附近的地面炸讓春野失去重并摔倒箱子滾出晶球體。爆炸引的碎石開始落向野，而這倫多博的助手就被掩埋。在天空中的兩神奇寶貝也沒閑，裂空坐開始用體緊纏代歐，讓歐無法動彈。 小超后頭跟著其他，藉由那個光芒帶領(lǐng)下繼續(xù)向前。小超現(xiàn)在了解何代歐奇希斯不要孤獨(dú)，并感同受地決定要成為歐的朋友。其他也決定幫助小超息裂空坐與代歐爭。此時春野掙瓦礫堆，一邊咒水晶球體帶來他麻煩。春野這時惑地找尋水晶球的下落，但立刻誓旦旦地自信一能很快找到。他出遙控器按了鈕激發(fā)不遠(yuǎn)處的水球體射出強(qiáng)光。天空中，被裂空纏住的代歐往下到晶體，臉上頓露出憤怒的表情回到地上，引導(dǎo)超的光芒正往水球體發(fā)出的強(qiáng)光近，小智則興高烈地說找到了。隆覺得奇怪為何晶球體會發(fā)出強(qiáng)，大家便蹲下來詳。此時春野出說水晶球體是他，并伸手準(zhǔn)備拿時候，一群影子歐過來把春野包住了。阿隆認(rèn)為們也是要來拿水球體，此時小智定，這次要幫助野…！?